Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF4P34130 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTF4P34130 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NTF4P34130 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NTF4P34130 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NTF4P34130 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTF4P34130 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NTF4P34130 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NTF4P34130 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NTF4P34130 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NTF4P34130 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NTF4P34130 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NTF4P34130 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NTF4P34130 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NTF4P34130 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTF4P34130 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NTF4P34130 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms