Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms