Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms