Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms