Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A1P22736 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms