Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms