Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms