Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms