Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BMP4P12644 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BMP4P12644 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BMP4P12644 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms