Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI4P10075 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI4P10075 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI4P10075 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI4P10075 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI4P10075 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI4P10075 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI4P10075 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI4P10075 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI4P10075 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI4P10075 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI4P10075 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GLI4P10075 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GLI4P10075 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GLI4P10075 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms