Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms