Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM228BP0C875 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms