Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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