Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms