Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-HP01893 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-HP01893 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-HP01893 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms