Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C6orf47O95873 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms