Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.521e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.541e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.541e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.561e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.661e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.71e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.771e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 BSG-205ENST00000571735 2155 ntTSL 216.87■□□□□ 0.292e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.926e-8■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 ATP1A1-211ENST00000537345 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SKIV2L-215ENST00000494058 867 ntTSL 212.63□□□□□ -0.397e-7■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SKIV2L-203ENST00000461915 691 ntTSL 510.65□□□□□ -0.77e-7■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 03e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 RAB5B-203ENST00000546810 589 ntTSL 212.71□□□□□ -0.373e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 RAB5B-204ENST00000548068 596 ntTSL 412.44□□□□□ -0.423e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 RAB5B-206ENST00000549505 3148 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.743e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 RAB5B-210ENST00000553116 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.063e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.273e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 RAB5B-209ENST00000551459 569 ntTSL 45.45□□□□□ -1.543e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 RAB5B-207ENST00000549915 494 ntTSL 44.02□□□□□ -1.773e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.613e-8■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 AC025682.1-204ENST00000580045 733 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.963e-8■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.663e-8■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.22e-7■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.49e-8■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SPAG4-206ENST00000468248 1181 ntTSL 520.97■□□□□ 0.959e-10■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.419e-10■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SPAG4-207ENST00000498203 687 ntTSL 516.62■□□□□ 0.259e-10■■□□□ 12.3
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PRPF4O43172 SPAG4-204ENST00000462896 368 ntTSL 310.22□□□□□ -0.779e-10■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 MAZ-211ENST00000567444 635 ntTSL 221.29■■□□□ 16e-7■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 RBPJ-230ENST00000515023 388 ntTSL 53.63□□□□□ -1.834e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.922e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 AES-210ENST00000590067 1100 ntTSL 215.69■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 AES-209ENST00000587393 1082 ntTSL 215.63■□□□□ 0.092e-6■■□□□ 12.3
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PRPF4O43172 AES-211ENST00000592330 275 ntTSL 53.62□□□□□ -1.832e-6■■□□□ 12.3
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PRPF4O43172 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.183e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.123e-8■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.113e-8■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.123e-8■■□□□ 12.3
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PRPF4O43172 ACIN1-206ENST00000473758 3540 ntTSL 1 (best)11.56□□□□□ -0.563e-8■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 ARID3A-202ENST00000457152 549 ntTSL 512.44□□□□□ -0.423e-7■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 MINK1-208ENST00000572629 827 ntTSL 315.39■□□□□ 0.052e-6■■□□□ 12.2
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PRPF4O43172 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-8■■□□□ 12.2
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PRPF4O43172 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.186e-10■■□□□ 12.2
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PRPF4O43172 SFT2D1-204ENST00000487841 2576 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.281e-9■■□□□ 12.2
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PRPF4O43172 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.461e-6■■□□□ 12.2
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PRPF4O43172 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.142e-6■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-6■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 EIF4G1-222ENST00000442406 5129 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.082e-6■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.15e-8■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 TRIB3-203ENST00000449710 1070 ntTSL 516.43■□□□□ 0.225e-8■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 TRIB3-204ENST00000615226 877 ntTSL 34.89□□□□□ -1.635e-8■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 EEF1D-208ENST00000524883 828 ntTSL 217.63■□□□□ 0.412e-6■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 COASY-213ENST00000591753 2225 ntTSL 1 (best)17.7■□□□□ 0.426e-9■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 COASY-209ENST00000588353 387 ntTSL 315.44■□□□□ 0.066e-9■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 COASY-214ENST00000591779 994 ntTSL 214.97□□□□□ -0.016e-9■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.046e-9■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.226e-9■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 COASY-201ENST00000393818 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.346e-9■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 EEF1D-237ENST00000531281 813 ntTSL 216.34■□□□□ 0.211e-6■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.666e-7■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 FOXA3-202ENST00000594297 538 ntTSL 314.8□□□□□ -0.046e-7■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.426e-7■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.416e-7■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.676e-7■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.282e-7■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 CCDC183-204ENST00000479371 1786 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.182e-7■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 CCDC183-205ENST00000481601 1556 ntTSL 215.4■□□□□ 0.062e-7■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 CCDC183-203ENST00000430612 2321 ntTSL 215.26■□□□□ 0.032e-7■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 SPPL2B-214ENST00000622308 749 ntTSL 1 (best)16.24■□□□□ 0.199e-8■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 TRMT2A-217ENST00000488335 379 ntTSL 315.35■□□□□ 0.059e-8■■□□□ 12.2
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