Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TO15178 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TO15178 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TO15178 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TO15178 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TO15178 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TO15178 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TO15178 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TO15178 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TO15178 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TO15178 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TO15178 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TO15178 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TO15178 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TO15178 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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