Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IDSB3KWA1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms