Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB2A8KAH6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms