Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KNCNA6PVL3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms