Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCP1A6NGW2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms