Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms