Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms