Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms