Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMC9Q9Y3B6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms