Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms