Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms