Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX6Q9UPM6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms