Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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TMCC3Q9ULS5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TMCC3Q9ULS5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TMCC3Q9ULS5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TMCC3Q9ULS5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TMCC3Q9ULS5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TMCC3Q9ULS5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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