Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYTH4Q9UIA0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms