Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms