Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms