Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CKLFQ9UBR5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CKLFQ9UBR5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CKLFQ9UBR5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CKLFQ9UBR5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CKLFQ9UBR5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CKLFQ9UBR5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CKLFQ9UBR5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CKLFQ9UBR5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CKLFQ9UBR5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CKLFQ9UBR5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CKLFQ9UBR5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms