Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XCL2Q9UBD3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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