Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms