Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms