Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UTP6Q9NYH9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms