Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms