Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms