Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC4Q9NTJ3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms