Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms