Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms