Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms