Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE7BQ9NP56 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms