Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRHQ9HD43 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms