Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR6Q9HBX8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGR6Q9HBX8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms