Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms