Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PACSIN1Q9BY11 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms