Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSPO3Q9BXY4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSPO3Q9BXY4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSPO3Q9BXY4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSPO3Q9BXY4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms